{"id":6493,"date":"2023-04-13T09:58:45","date_gmt":"2023-04-13T12:58:45","guid":{"rendered":"https:\/\/allumiqs.com\/precipitation-a-haut-debit-avec-le-protrap-ht\/"},"modified":"2023-12-01T09:25:19","modified_gmt":"2023-12-01T13:25:19","slug":"precipitation-a-haut-debit-avec-le-protrap-ht","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/precipitation-a-haut-debit-avec-le-protrap-ht\/","title":{"rendered":"Pr\u00e9cipitation \u00e0 haut d\u00e9bit avec le ProTrap HT"},"content":{"rendered":"\n

Par Jessica Nickerson, R&D Scientist chez Allumiqs<\/strong><\/p>\n\n

La prot\u00e9omique \u00e9volue rapidement, tout comme les outils de pr\u00e9paration d’\u00e9chantillons qui soutiennent nos workflows. Chez Allumiqs, nous nous engageons \u00e0 aider les chercheurs \u00e0 r\u00e9imaginer les workflows bas\u00e9s sur la pr\u00e9cipitation en solvant organique afin de permettre une r\u00e9cup\u00e9ration maximale et un \u00e9puisement des tensioactifs pour une r\u00e9cup\u00e9ration robuste d’un \u00e9chantillon de prot\u00e9ome. Dans des articles pr\u00e9c\u00e9dents, nous avons parl\u00e9 du d\u00e9veloppement de la cartouche de filtration ProTrap XG par le groupe de recherche du Dr Alan Doucette (je suis un ancien membre de ce groupe) pour faciliter et simplifier la pr\u00e9cipitation des prot\u00e9ines \u00e0 l’aide de solvants organiques. Alors que nos recherches au laboratoire Doucette ont acc\u00e9l\u00e9r\u00e9 l’\u00e9tape critique de la pr\u00e9cipitation, l’\u00e9quipe produit d’Allumiqs \u00e9l\u00e8ve maintenant nos outils de pr\u00e9paration d’\u00e9chantillons avec la nouvelle plaque filtrante ProTrap HT afin de r\u00e9pondre aux besoins des clients pour les pr\u00e9parations de routine et \u00e0 grande \u00e9chelle qui exigent des r\u00e9ductions suppl\u00e9mentaires dans la manipulation des \u00e9chantillons et des workflows semi-automatis\u00e9s et enti\u00e8rement automatis\u00e9s.<\/p>\n\n

Pr\u00e9paration d’\u00e9chantillons mains libres !<\/strong><\/h3>\n\n

Nous sommes ravis d’appliquer nos m\u00e9thodologies \u00e0 un nouveau format \u00e0 haut d\u00e9bit avec nos plaques filtrantes \u00e0 96 puits<\/a> et d’\u00e9quiper nos clients avec ce nouveau niveau de pr\u00e9paration d’\u00e9chantillons. Alors que la cartouche d’essorage permettait d’isoler le culot prot\u00e9ique sans aucune difficult\u00e9 technique, la nouvelle plaque filtrante permet une automatisation compl\u00e8te, minimisant ainsi les variabilit\u00e9s techniques associ\u00e9es \u00e0 la pr\u00e9paration des \u00e9chantillons. La plaque filtrante est tr\u00e8s polyvalente et compatible avec les workflows courants de l’A200. Les prot\u00e9ines pr\u00e9cipit\u00e9es sont r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es soit par centrifugation, soit par pression positive ou n\u00e9gative, ce qui permet une digestion ult\u00e9rieure sur membrane. Nos \u00e9tudes de validation rigoureuses, men\u00e9es par nos \u00e9quipes de produits et de services de spectrom\u00e9trie de masse, ont d\u00e9montr\u00e9 que la configuration de la plaque filtrante permet la m\u00eame r\u00e9cup\u00e9ration quantitative, le m\u00eame appauvrissement en tensioactifs et la m\u00eame reproductibilit\u00e9 globale que le format original de la cartouche d’essorage.<\/p>\n\n

\"\"<\/figure>\n\n

Jusqu’o\u00f9 pouvons-nous descendre ?<\/strong><\/h3>\n\n

Notre \u00e9quipe a entrepris d’optimiser les protocoles de traitement d’environ 50 \u00b5g de mat\u00e9riel de d\u00e9part, y compris un workflow personnalis\u00e9 et un kit de r\u00e9actifs pour la pr\u00e9paration du s\u00e9rum\/plasma. Une fois ce niveau atteint, nous avons r\u00e9cemment commenc\u00e9 \u00e0 \u00e9tudier jusqu’\u00e0 quel niveau il est possible de descendre, en d\u00e9montrant les performances de la plaque filtrante pour le traitement d’\u00e9chantillons dilu\u00e9s ou limit\u00e9s en volume. <\/p>\n\n

Les r\u00e9sultats d’une pr\u00e9paration ascendante d’une lign\u00e9e de cellules mononucl\u00e9aires humaines ont montr\u00e9 la quantification de 16 000 \u00e0 20 000 peptides et de 2 500 \u00e0 3 000 prot\u00e9ines par SWATH MS \u00e0 partir de seulement 2 \u00e0 10 \u00b5g de prot\u00e9ines. Une comparaison directe entre la plaque filtrante et un flacon conventionnel a \u00e9t\u00e9 effectu\u00e9e sur de faibles quantit\u00e9s initiales de CSF. L’analyse par SWATH MS ascendante a montr\u00e9 qu’une pr\u00e9paration automatis\u00e9e de seulement 1 \u00b5g de prot\u00e9ine initiale dans la plaque filtrante \u00e0 haut d\u00e9bit correspondait \u00e0 la pr\u00e9cision quantitative d’un workflow de pr\u00e9cipitation manuelle tout en augmentant la couverture du prot\u00e9ome. <\/p>\n\n

Nous vous en dirons plus \u00e0 l’ASMS 2023 \u00e0 Houston<\/a>, o\u00f9 nous pr\u00e9senterons un nouveau poster sur d’autres de nos d\u00e9couvertes<\/a> concernant les faibles quantit\u00e9s de mati\u00e8res premi\u00e8res. J’esp\u00e8re vous y voir<\/a> !<\/p>\n\n

D’ici l\u00e0, je serais heureux de discuter avec vous de la mise en \u0153uvre de la nouvelle plaque filtrante dans votre workflow. Contactez-moi \u00e0 tout moment \u00e0 l’adresse suivante: jnickerson@allumiqs.com<\/a><\/p>\n\n

Nous souhaitons collaborer avec des clients comme vous pour faire avancer vos objectifs de recherche. Il se peut que vous ayez besoin de protocoles personnalis\u00e9s et notre \u00e9quipe serait heureuse de travailler avec vous sur ce type d’initiative.<\/p>\n\n

Plus d’informations sur le ProTrap HT \u2b07\ufe0f <\/p>\n\n

Pour une flexibilit\u00e9 maximale, nous proposons nos plaques \u00e0 96 puits dans ces configurations d’emballage :<\/p>\n\n

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Cat.No.<\/strong><\/td>Nom du produit<\/strong><\/td>Description<\/strong><\/td><\/tr>
PWP-1001<\/td>Plaques de 96 puits ProTrap HT 5PK<\/a><\/td>Cinq (5) plaques de filtration<\/td><\/tr>
PWP-R001<\/td>Plaque de 96 puits ProTrap HT + r\u00e9actifs pour s\u00e9rum\/plasma<\/a><\/td>Une (1) plaque avec le tampon SDS et le tampon de digestion – une bonne fa\u00e7on d’essayer la plaque dans votre workflow – c’est une bonne plaque pour commencer l’\u00e9valuation, contactez sales@allumiqs.com<\/a> pour voir si votre laboratoire peut b\u00e9n\u00e9ficier d’un pack d’\u00e9valuation gratuit.<\/td><\/tr>
PWP-R002<\/td>Plaques de 96 puits ProTrap HT 5PK + r\u00e9actifs pour s\u00e9rum\/plasma<\/a><\/td>Cinq (5) plaques avec tampon SDS et tampon de digestion<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n
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Achetez-le maintenant<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n

<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

En savoir plus sur le dernier n\u00e9 de notre gamme de produits de pr\u00e9paration d’\u00e9chantillons. La plaque de 96 puits ProTrap HT pour la pr\u00e9cipitation \u00e0 haut d\u00e9bit.<\/p>\n","protected":false},"author":27,"featured_media":6496,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"inline_featured_image":false,"_EventAllDay":false,"_EventTimezone":"","_EventStartDate":"","_EventEndDate":"","_EventStartDateUTC":"","_EventEndDateUTC":"","_EventShowMap":false,"_EventShowMapLink":false,"_EventURL":"","_EventCost":"","_EventCostDescription":"","_EventCurrencySymbol":"","_EventCurrencyCode":"","_EventCurrencyPosition":"","_EventDateTimeSeparator":"","_EventTimeRangeSeparator":"","_EventOrganizerID":[],"_EventVenueID":[],"_OrganizerEmail":"","_OrganizerPhone":"","_OrganizerWebsite":"","_VenueAddress":"","_VenueCity":"","_VenueCountry":"","_VenueProvince":"","_VenueState":"","_VenueZip":"","_VenuePhone":"","_VenueURL":"","_VenueStateProvince":"","_VenueLat":"","_VenueLng":"","_VenueShowMap":false,"_VenueShowMapLink":false,"footnotes":""},"categories":[96],"tags":[],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/6493"}],"collection":[{"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/27"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=6493"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/6493\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":6497,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/6493\/revisions\/6497"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/6496"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=6493"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=6493"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=6493"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}