par Victoria Miller, Scientifique S\u00e9nior<\/p>\n\n
Les r\u00e9sultats de la spectroscopie de masse peuvent \u00eatre compromis de nombreuses fa\u00e7ons ; tout, depuis les d\u00e9tergents utilis\u00e9s pendant l’extraction et la solubilisation jusqu’aux qualit\u00e9s chimiques des solvants utilis\u00e9s pendant l’analyse, peut avoir un impact sur les r\u00e9sultats.<\/p>\n\n
Le poly\u00e9thyl\u00e8ne glycol ou PEG fait partie de ces contaminants qui peuvent vous surprendre de mani\u00e8re inattendue. La seule \u00ab\u00a0bonne\u00a0\u00bb chose \u00e0 propos d’une contamination par le PEG, c’est que lorsqu’elle est pr\u00e9sente, vous savez de quoi il s’agit. Cette r\u00e9p\u00e9tition de +44 Da n’est pas ce que l’on veut voir dans un chromatogramme, sauf bien s\u00fbr si l’on \u00e9tudie le PEG ! <\/p>\n\n
Le probl\u00e8me avec le PEG, c’est qu’on peut le trouver \u00e0 peu pr\u00e8s partout ! Lorsque j’ai commenc\u00e9 \u00e0 me familiariser avec la pr\u00e9paration des \u00e9chantillons dans le monde de la spectrom\u00e9trie de masse, je n’avais aucune id\u00e9e de la facilit\u00e9 avec laquelle le PEG pouvait s’introduire dans votre \u00e9chantillon. Voici un r\u00e9sum\u00e9 des informations que j’ai pu glaner sur Internet. Il existe une pl\u00e9thore de bons conseils sur le web, \u00e9manant de personnes plus exp\u00e9riment\u00e9es que moi dans le domaine de la spectrom\u00e9trie de masse, et j’esp\u00e8re que mon r\u00e9sum\u00e9 vous aidera \u00e0 progresser dans votre parcours en spectrom\u00e9trie de masse. <\/p>\n\n
Les solvants utilis\u00e9s pour l’analyse constituent une source potentielle de PEG. Ne stockez pas (ou n’achetez pas !) de solvants dans des bouteilles en plastique pour l’analyse par spectrom\u00e9trie de masse. Les PEG et autres plastifiants peuvent \u00eatre lessiv\u00e9s dans le solvant et appara\u00eetre dans votre chromatogramme. La m\u00eame r\u00e8gle s’applique aux bouteilles utilis\u00e9es pour charger les solvants dans le LC-MS : l\u00e0 encore, n’utilisez pas de bouteilles en plastique et, plus important encore, lorsque vous lavez la verrerie pour mesurer, m\u00e9langer et stocker vos solvants, n’utilisez pas de d\u00e9tergent contenant des PEG ou, \u00e0 tout le moins, rincez la verrerie \u00e0 l’eau tr\u00e8s chaude, puis \u00e0 l’aide d’un solvant organique avant de l’utiliser. <\/p>\n\n
Le Triton X-100 et le NP-40 (et ses substituts) sont des d\u00e9tergents PEGyl\u00e9s qui doivent \u00eatre \u00e9vit\u00e9s lors de l’extraction des prot\u00e9ines. Nous sommes convaincus que nous pouvons \u00e9liminer le SDS de votre \u00e9chantillon et nous vous encourageons \u00e0 voir ce que le SDS peut faire pour votre protocole d’extraction. <\/p>\n\n
Le PEG peut entrer dans votre workflow \u00e0 de nombreuses \u00e9tapes. Les unit\u00e9s de filtration des seringues peuvent en \u00eatre la source, de m\u00eame que toute membrane utilis\u00e9e pour la concentration. Si vous vous m\u00e9fiez de vos membranes, rincez-les 2 ou 3 fois avec de l’eau d\u00e9ionis\u00e9e pour \u00e9liminer ces contaminants. Certaines pointes de pipette et certains tubes de microfuge peuvent lib\u00e9rer du PEG, en particulier s’ils sont utilis\u00e9s pour des solvants agressifs. De nombreux articles de soins personnels, y compris les cr\u00e8mes pour les mains, contiennent du PEG, ne serait-ce qu’\u00e0 l’\u00e9tat de traces. Veillez \u00e0 porter des gants lorsque vous manipulez quoi que ce soit qui se trouve \u00e0 proximit\u00e9 de vos \u00e9chantillons. Envisagez d’avoir de la verrerie d\u00e9di\u00e9e uniquement \u00e0 la pr\u00e9paration des solvants de spectrom\u00e9trie de masse. Si vous effectuez une digestion en gel, pr\u00e9voyez un ensemble de bo\u00eetes de coloration de gel uniquement pour les exp\u00e9riences de spectrom\u00e9trie de masse. Cela permettra \u00e9galement d’\u00e9viter la contamination par la k\u00e9ratine. <\/p>\n\n