{"id":6617,"date":"2021-03-11T09:28:00","date_gmt":"2021-03-11T13:28:00","guid":{"rendered":"https:\/\/allumiqs.com\/science\/preparation-descendante-des-echantillons-avec-le-protrap\/"},"modified":"2024-01-11T17:20:21","modified_gmt":"2024-01-11T21:20:21","slug":"preparation-descendante-des-echantillons-avec-le-protrap","status":"publish","type":"science","link":"https:\/\/allumiqs.com\/fr\/science\/preparation-descendante-des-echantillons-avec-le-protrap\/","title":{"rendered":"Pr\u00e9paration Top Down des \u00e9chantillons avec le ProTrap"},"content":{"rendered":"\n

T\u00e9l\u00e9chargez le protocole de pr\u00e9paration des \u00e9chantillons Top Down en version anglaise (PDF)<\/a><\/p>\n\n

Le protocole sugg\u00e9r\u00e9 ci-dessous a \u00e9t\u00e9 optimis\u00e9 en utilisant des concentrations maximales et minimales de prot\u00e9ines de 0,5 mg\/mL et 0,01 mg\/mL respectivement et est fourni pour d\u00e9montrer les utilisations potentielles du ProTrap XG.<\/p>\n\n

Notre \u00e9quipe travaille avec les clients pour optimiser les protocoles en fonction de votre workflow, de votre type d’\u00e9chantillon et de vos objectifs de recherche. Prenez contact avec nous \u00e0 l’adresse sales@allumiqs.com<\/a> pour en savoir plus sur la mani\u00e8re dont nous pouvons vous aider. <\/strong><\/p>\n\n

NOTES DE PR\u00c9PARATIONLe ProTrap XG est optimis\u00e9 pour traiter 50 \u00b5g de prot\u00e9ines. Pour une pr\u00e9cipitation reproductible et maximale des prot\u00e9ines, la teneur maximale en SDS de votre \u00e9chantillon pendant la pr\u00e9cipitation doit \u00eatre de 1 %. Si votre tampon d’extraction ou de lyse contient plus de 1% de SDS, diluez-le avec un tampon contenant une force ionique maximale de 300 mM. Les vitesses d’essorage sont bas\u00e9es sur une microcentrifugeuse standard de paillasse avec un rotor de 24 x 1,5\/2,0 ml.Les temps indiqu\u00e9s le sont \u00e0 titre indicatif.S’il reste plus de quelques microlitres de liquide dans la cartouche de filtration apr\u00e8s un essorage, replacez-la dans la centrifugeuse et recommencez la centrifugation, ou envisagez d’augmenter la vitesse d’essorage. Une vitesse de 3000 \u00d7g (6000 rpm) est recommand\u00e9e pour les centrifugations suivantes et le ProTrap XG a \u00e9t\u00e9 test\u00e9 jusqu’\u00e0 9000 \u00d7g (10 000 rpm). <\/p>\n\n

MAT\u00c9RIEL REQUISTous les produits chimiques et r\u00e9actifs doivent \u00eatre de qualit\u00e9 ACS\/HPLC ou sup\u00e9rieure.<\/em>Ac\u00e9toneNaCl 5 M dans l’eau80% Acide Formique Acid dans l’eau (refroidit \u00e0 \u201320\u00b0C)Eau r\u00e9frig\u00e9r\u00e9e<\/p>\n\n

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PROTOCOLE DE PR\u00c9PARATION D’\u00c9CHANTILLONS TOP-DOWN<\/p>\n\n

Pour une pr\u00e9cipitation reproductible et maximale des prot\u00e9ines, la teneur maximale en SDS de votre \u00e9chantillon pendant la pr\u00e9cipitation doit \u00eatre de 1 %. Si votre tampon d’extraction ou de lyse contient plus de 1% de SDS, diluez-le avec un tampon contenant une force ionique maximale de 300 mM. Pour une exp\u00e9rience optimale, votre \u00e9chantillon doit contenir au moins 50 mM de NaCl. Si vous devez ajouter du NaCl, utilisez une solution de NaCl 5 M.<\/p>\n\n