Nouveaux réactifs et kits en vrac permettant d’accélérer les workflows de sérum/plasma avec l’outil de préparation d’échantillons ProTrap XG

Par Victoria Miller, Scientifique Sénior & Jean-François Noël, Scientifique R&D

Lorsque Allumiqs et PhenoSwitch Bioscience se sont associées plus tôt cette année, l’un des principaux domaines d’intérêt scientifique était l’intégration de l’expérience et des connaissances approfondies en omique de Sherbrooke à la cartouche de préparation d’échantillons universelle ProTrap XG. Les membres des laboratoires de Halifax et de Sherbrooke ont collaboré à la création d’un tampon SDS pour diluer et dénaturer les échantillons et d’un tampon complémentaire pour optimiser les conditions de digestion de l’échantillon nettoyé. L’objectif était de fournir aux clients des tampons prêts à l’emploi et un outil de préparation des échantillons afin de faciliter et d’accélérer leurs flux de travail en protéomique du sérum/plasma. Nous avons travaillé sur une myriade de conditions, pour aboutir à des tampons qui sont le fruit d’années d’expérience sur les bancs de PhenoSwitch et de son cofondateur, le professeur Alan Doucette, ainsi que de ce que nous avons appris de nos clients ProTrap.

Nous avons trouvé une combinaison qui donne des résultats cohérents avec les échantillons de sérum et de plasma et nous avons formulé différents formats pour une flexibilité maximale du client. D’autres réactifs, protocoles et kits destinés à d’autres types d’échantillons sont en cours d’élaboration.

Les réactifs en vrac prêts à l’emploi sont idéaux pour les utilisateurs qui disposent déjà de solvants et n’ont pas besoin d’en introduire d’autres dans le laboratoire. La formulation du tampon de dilution/dénaturation de l’échantillon (tampon SDS) a été optimisée pour la précipitation des protéines de l’échantillon, avec un pH et des concentrations de détergent optimisés afin que vous n’ayez pas à vous soucier de l’élimination de ces produits chimiques lors de l’utilisation de la cartouche de filtration ProTrap XG. Le tampon de digestion est conçu pour fonctionner avec un mélange Trypsine/Lys-C ; nous fournissons des suggestions de fournisseurs dans le protocole. Dans notre boutique en ligne, nous proposons deux tailles de cartouches de filtration ProTrap XG à combiner avec nos paquets de 50 et 100.

Notre kit de préparation d’échantillons de sérum/plasma pour 10 échantillons contient tous les réactifs dont vous aurez besoin pour diluer et dénaturer, réduire, alkyler, précipiter, laver et préparer votre échantillon pour la digestion. Vous devrez fournir la protéase (nous vous suggérons notre fournisseur préféré de Trypsine/Lys-C) pour la digestion et le matériel SPE.

Nous sommes ravis d’élargir notre gamme de produits pour aider les utilisateurs à simplifier la préparation d’échantillons par spectrométrie de masse. Nous aimerions travailler avec vous pour trouver la bonne solution à votre question. Contactez-nous à l’adresse support@allumiqs.com pour contacter nos spécialistes de l’assistance technique. Dites-nous quels types d’échantillons vous posent problème, nous avons beaucoup d’idées en cours de développement.

Et restez à l’écoute pour le lancement de notre prochain produit à l’occasion de HUPO 2022 !